Logo BSU

Please use this identifier to cite or link to this item: https://elib.bsu.by/handle/123456789/236253
Title: Функциональный анализ геномов Pectobacterium, 2.24 : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научный руководитель Е. А. Николайчик
Authors: Николайчик, Е. А.
Качан, А. В.
Дюбо, Ю. В.
Keywords: ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Биология
ЭБ БГУ::ТЕХНИЧЕСКИЕ И ПРИКЛАДНЫЕ НАУКИ. ОТРАСЛИ ЭКОНОМИКИ::Биотехнология
Issue Date: 2018
Publisher: Минск : БГУ
Abstract: Объектом настоящего исследования являлись бактерии Pectobacterium carotovorum и Pectobacterium atrosepticum. Цель НИР: секвенирование и функциональный анализ полных геномных последовательностей Pectobacterium carotovorum и Pectobacterium atrosepticum. Работа выполнялась современными молекулярно-биологическими методами, включая ПЦР, молекулярное клонирование, направленный мутагенез, секвенирование следующего поколения и геномную биоинформатику. Ключевыми методическими подходами, наиболее критичными для выполнения работы, служили использование геномного секвенатора для расшифровки полных последовательностей фитопатогенных бактерий, а также разработка специализированного программного обеспечения для анализа и редактирования аннотированных геномных. В результате расшифрована последовательность геномов патогенов картофеля Pectobacterium carotovorum 14A и P. atrosepticum 36A, а также проведен сравнительный анализ секвенированных геномов четырех штаммов пектобактерий для оценки разнообразия представленных в РБ штаммов этого фитопатогена и уточнения их таксономической позиции; разработан программный пакет SigmoID для характеристики и поиска в геномных последовательностях сайтов связывания транскрипционных факторов, повторов, а также для редактирования аннотации геномных последовательностей; созданы коллекции профилей поиска операторов и промоторов для двух групп бактерий: пектолитических энтеробактерий и псевдомонад; показана возможность существенного улучшения аннотации бактериальных геномов на основе анализа сигналов контроля транскрипции. Программный код и исполняемые файлы SigmoID размещены в свободном репозитории (github.org/nikolaichik/SigmoID). Для двух геномных последовательностей Pectobacterium spp. аннотация скорректирована и дополнена информацией о регуляторных элементах. Расшифрованные впервые, а также модифицированные в ходе настоящей работы геномные последовательности четырех штаммов депонированы в базе данных GenBank.
URI: http://elib.bsu.by/handle/123456789/236253
Registration number: № госрегистрации 20161708
Appears in Collections:Отчеты 2018

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Николайчик Е.А..pdf6,11 MBAdobe PDFView/Open


PlumX

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.