Logo BSU

Please use this identifier to cite or link to this item: https://elib.bsu.by/handle/123456789/273772
Title: Моделирование пространств кодовых последовательностей высокой сложности и их использование при сборке и анализе структуры крупных геномов : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научные руководители В. И. Чесалин, Н. В. Воронова
Authors: Чесалин, В. И.
Воронова, Н. В.
Яблонский, О. Л.
Вертелко, В. Р.
Шулинский, Р. С.
Левыкина, С. С.
Крук, В. Л.
Keywords: ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Биология
ЭБ БГУ::ТЕХНИЧЕСКИЕ И ПРИКЛАДНЫЕ НАУКИ. ОТРАСЛИ ЭКОНОМИКИ::Биотехнология
ЭБ БГУ::ОБЩЕСТВЕННЫЕ НАУКИ::Информатика
ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Математика
Issue Date: 2020
Publisher: Минск : БГУ
Abstract: Объектами исследования являлись геномы тлей A. fabae mordvilkoi и A. craccivora. Предмет исследования – эффективные методы сборки геномов тлей A. fabae mordvilkoi и A. craccivora. Цель исследования – получение новых научно обоснованных данных об эффективности различных подходов и применяемых алгоритмов для сборки крупных геномов эукариотических организмов, а также проведение рабочей сборки генома A. fabae mordvilkoi с применением разработанной методики математического моделирования цепочек генетического кода. В работе использованы биоинформационные методы: сборка и аннотация геномов; математические методы: вероятностно-статистические и конструктивно-аналитические методы анализа. В проекте представлены результаты сборки геномов тлей A. craccivora, A. fabae mordvilkoi, митохондриального генома A. fabae mordvilkoi и бактериального генома B. aphidicola из A. craccivora. Установлено, что оценки средних значений разностей сочетаний нуклеотидов в собранных геномах A. fabae mordvilkoi и A. craccivora и аналогичных количествах в прочтениях геномов примерно одинаковы. При этом показано, что участки собранных геномных последовательностей любой длины, рассматриваемые как произведение случайных событий, являются сильно зависимыми событиями. В работе приведено описание системы уравнений со сдвигом, решения которых являются односторонними и двусторонними кодовыми последовательностями, позволяющими моделирование различных участков геномов. Проведенное компьютерное тестирование разработанных новых методик генерирования кодовых последовательностей показало возможность создания принципиально новых подходов к сборке de-novo геномов эукариот.
URI: https://elib.bsu.by/handle/123456789/273772
Registration number: Рег. № НИР 20190532
Licence: info:eu-repo/semantics/closedAccess
Appears in Collections:Отчеты 2020

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Отчет 20190532 Чесалин, Воронова.docx9,54 MBMicrosoft Word XMLView/Open
Show full item record Google Scholar



PlumX

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.